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新華社杭州6月26日電(記者朱涵)杭州華大生命科學研究院與南方科技大學創(chuàng)建了一個解碼動物發(fā)育過程的多模態(tài)數(shù)據(jù)集,生成了果蠅全發(fā)育周期的3D單細胞時空多組學圖譜,為生物發(fā)育提供了分子層面的參考,有望為發(fā)育缺陷及相關疾病機制研究奠定基礎。相關成果26日發(fā)表于國際學術期刊《細胞》。
研究人員介紹,動物發(fā)育是基因與細胞在時空維度上精密協(xié)作的復雜過程。以果蠅為例,其發(fā)育的過程,大體需要經過卵、幼蟲、蛹和成蟲4個階段。如果說這個成長過程,是一場精密編排的“生命舞臺劇”,那么每個細胞何時何地“登場”、如何變成特定的細胞類型,便都是由基因“劇本”調控的。
研究團隊基于華大自主研發(fā)技術,對果蠅胚胎每0.5至2小時、幼蟲及蛹期的各個關鍵階段進行采樣,生成超過380萬個空間分辨的單細胞轉錄組,并利用“Spateo”算法工具重建出高精度3D模型,精準解析組織形態(tài)與基因表達的空間動態(tài)。通過整合數(shù)據(jù),進一步構建了果蠅胚胎發(fā)育的“分化軌跡地圖”,解析了細胞命運決定的關鍵分子機制。
“研究發(fā)現(xiàn),不同胚層的細胞會沿著特定路徑分化,轉錄因子就像‘導演’,通過激活或抑制基因,指揮細胞扮演特定角色!蔽恼鹿餐谝蛔髡、杭州華大生命科學研究院專項科學家王明月說,研究發(fā)現(xiàn)多個此前未被鑒定的轉錄因子,在神經、腸道及內分泌系統(tǒng)中可能起關鍵作用。
王明月表示,果蠅與人類共享約70%的疾病相關基因,理解其發(fā)育過程及基因調控機制,能夠幫助我們更好地探究生命發(fā)育等重要科學問題,并為人類發(fā)育疾病領域相關研究提供參考。
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新華社杭州6月26日電(記者朱涵)杭州華大生命科學研究院與南方科技大學創(chuàng)建了一個解碼動物發(fā)育過程的多模態(tài)數(shù)據(jù)集,生成了果蠅全發(fā)育周期的3D單細胞時空多組學圖譜,為生物發(fā)育提供了分子層面的參考,有望為發(fā)育缺陷及相關疾病機制研究奠定基礎。相關成果26日發(fā)表于國際學術期刊《細胞》。
研究人員介紹,動物發(fā)育是基因與細胞在時空維度上精密協(xié)作的復雜過程。以果蠅為例,其發(fā)育的過程,大體需要經過卵、幼蟲、蛹和成蟲4個階段。如果說這個成長過程,是一場精密編排的“生命舞臺劇”,那么每個細胞何時何地“登場”、如何變成特定的細胞類型,便都是由基因“劇本”調控的。
研究團隊基于華大自主研發(fā)技術,對果蠅胚胎每0.5至2小時、幼蟲及蛹期的各個關鍵階段進行采樣,生成超過380萬個空間分辨的單細胞轉錄組,并利用“Spateo”算法工具重建出高精度3D模型,精準解析組織形態(tài)與基因表達的空間動態(tài)。通過整合數(shù)據(jù),進一步構建了果蠅胚胎發(fā)育的“分化軌跡地圖”,解析了細胞命運決定的關鍵分子機制。
“研究發(fā)現(xiàn),不同胚層的細胞會沿著特定路徑分化,轉錄因子就像‘導演’,通過激活或抑制基因,指揮細胞扮演特定角色!蔽恼鹿餐谝蛔髡、杭州華大生命科學研究院專項科學家王明月說,研究發(fā)現(xiàn)多個此前未被鑒定的轉錄因子,在神經、腸道及內分泌系統(tǒng)中可能起關鍵作用。
王明月表示,果蠅與人類共享約70%的疾病相關基因,理解其發(fā)育過程及基因調控機制,能夠幫助我們更好地探究生命發(fā)育等重要科學問題,并為人類發(fā)育疾病領域相關研究提供參考。
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